高压灭菌器是用于消毒的各种类型的媒体，通过在压力下的干饱和蒸汽的手段加热室。为了获得干燥的饱和蒸汽，必须从高压灭菌器内的材料和高压灭菌器腔室本身中除去空气。 这可以通过多种方式来实现。
为了从质量大但表面积小的物品（例如瓶装介质）中去除空气，需要的去除空气zui少，并且自动空气吹扫就足够了，例如台式高压灭菌器。在这种情况下，当蒸汽从一体式源（向上排量）或从外部供应源（向下排量）进入时，允许空气排出腔室。仅当从腔室中除去所有空气后，通风孔才会关闭。进一步推广这种方法是“自由蒸煮”，在这种情况下，允许通风口保持打开状态一段设定的时间。然后，湍流蒸汽通过排气孔，迫使残留的空气排出高压灭菌器。对于包括许多气袋（例如，包裹的仪器或织物）的更困难的负载，需要更主动的排气方法。
去除空气zui活跃的方法是通过真空系统。使用真空系统时，在引入任何蒸汽之前以及在进行自由蒸汽或真空脉冲之前，应先将腔室排空。从腔室和介质中除去空气后，容器内的温度将随压力升高，直至达到预设温度。蒸汽加压到至少1.1 Bar G时，灭菌温度达到249.8F。由于压力大于0.5 Bar G，高压灭菌器被归类为压力容器，必须设计并通过ASME标准的认证，例如实验室方形高压灭菌器。
有多种方法可以在高压灭菌器室内达到温度和蒸汽：
蒸汽发生器或直接蒸汽的主要优点在于，周期时间可以大大缩短，而即时蒸汽不需要等待室内的热水。在室内装有基本加热器的情况下，必须手动补充水，一旦水沸腾就提供蒸汽。
当达到所需的温度和循环时间时，蒸汽供应将停止，温度和压力将开始逐渐下降。如果系统中包含真空系统，则可以更快速地排空蒸汽，以在循环结束时产生干燥机zui终产品。
灭菌后，可以移走物品（培养基，玻璃器皿，包裹的仪器等）并在实验室中安全可靠地使用；或丢弃废物时，可以离开实验室。
